Après la mission Sahara-Soudan, Roger Mourlan cesse de participer à des missions scientifiques, mais il continue de réaliser des documentaires avec son père dans leur studio de Montfermeil. Au début de la guerre, il est obligé de changer d’activité après la réquisition de leur matériel cinématographique par l’armée : il devient fabricants de jouets en bois, puis menuisier-ébéniste, avant de se reconvertir finalement dans la mécanique et l’électronique. Il retourne néanmoins en pays dogon quelques années avant sa mort en 1987 ^[9].