Quant à ses liens avec Griaule, ils se nouent à partir de 1935 par l’intermédiaire de Solange de Ganay. Ce sont d’ailleurs Griaule et Ganay qui parrainent Jean Lebaudy lors de son élection à la Société des africanistes, en février 1936. Aiguisées par leur goût commun pour l’Afrique et pour l’aviation ^[6], les relations amicales entre les deux hommes débouchent sur la mission ethnographique et cynégétique Lebaudy-Griaule de 1938-1939, entièrement financée par Jean Lebaudy.

Cette expédition à destination du Tchad est composée des deux équipes relativement autonomes et aux objectifs bien distincts : le couple Lebaudy a pour activité principale la chasse, tandis que le groupe d’ethnographes dirigé par Griaule effectue avant tout des enquêtes en pays dogon, kouroumba, sara et goula.

À la différence des objets usuels, déposés au Musée d’ethnographie du Trocadéro, les masques et les autres sculptures rapportés par la mission sont conservés par les Lebaudy afin d’être exposés dans leur musée de Cabrerets. En 1963, à l’occasion de la vente du château, ces objets sont offerts au département d’ethnologie de l’université de Strasbourg.

Jean Lebaudy ne se contente pas de financer l’expédition de 1938-1939 ; il subventionne également les publications issues des précédentes missions Griaule grâce aux quatre cahiers Geuthner de la collection Miscellanea Africana Lebaudy, qui paraissent entre 1939 et 1942 ^[7].